祝由科這種醫術甚為神奇，相傳是楚南（即湖南）破頭老祖所傳，凡是因刀槍及跌打致死的人，極短時間就能使其起死回生。
祝由科的祖師破頭老祖是北宋人，當時宋太祖聽聞其名，將他召入宮中。有一名小官因違逆皇上而被斬首，但實際上不是他的罪過，祖師私下為他把頭接上而起死回生。太祖大怒，讓武士用大斧砍掉祖師的頭並扔掉屍體。他的徒弟偷回屍體，用法術接上頭也使祖師起死回生了。此後破頭老祖逃到深山窮谷中，不再踏入塵世，至今已有千餘年，但其醫術尚在流傳。
祝由術分兩個流派：一派非重金聘請不救；另外一派則不受謝禮，見死必救。徒弟入門時要各自發誓願，如有違教者，身亡家滅，所以一直敬謹奉持著法規，不曾失傳。湖南販賣大米的商人，大多數是學習不受謝禮的那一派，其術甚為神奇。
剃刀刺腦 噴酒蓋紙起死回生
相傳有馮、陳二位商人到河北販賣大米，住在米行老闆家。某天兩人一同外出剃髮，坐在店裡等候。一位年輕剃髮匠正用小刀替客人掏耳朵時，有個無賴進來，出其不意的用手挖剃髮匠的屁股，剃髮匠失手將小刀插入客人腦袋，客人隨即倒地而亡。店裡的人驚惶無措，店主將無賴縛起來，準備報官。
此時，馮某對陳某說：「我等不能見死不救，何不用法術救他呢？」陳某說：「是。」店主聽到對話，馬上跪下來求情，馮某急忙阻止：「若是這樣就不能救了。我們救人是出自誠心才能應驗的。你馬上準備燒酒一斤，白紙一束，交給陳某做法。」
陳某用拇指掐著其他手指，向死者的耳朵噴酒，用一張白紙糊上，喃喃地念咒畫符，再次噴酒、蓋紙，反復做了數十次，直到白酒和紙張都用完而止。
陳某請眾人幫忙他將刀拔出，然後扶死者出門，大喝一聲：「走！」該客人就狂奔回家，妻子問話也不回答，只是躺在床上不動彈。家人不知何故，在床邊守了一夜。第二天早晨，那客人醒來才說：「我記得昨天剃髮匠用小刀刺進我耳朵，疼的昏迷過去，為何今日又無事了？」此時，剃髮店主、剃髮匠和無賴前來問候，才知事情始末。
高處摔地 黃土木板救命
清代某年，開封府官衙前面的旗竿頂損壞了，於是請工匠用繩子繫在絞盤上，上升到旗竿頂端來修理。工匠抵達旗竿頂端時，旗竿忽然被大風吹斷，工匠摔落下來，幾乎全身粉碎。
此時剛好有一精通祝由術的人路過，他笑著說：「無妨。」於是命人取來四塊木板，在其中一塊板上灑上黃土，將工匠放置在黃土上，在工匠身體左右各夾上一塊木板，又用黃土遍灑其身，用手捏劍訣，畫符咒，口中喃喃誦咒。念完咒後，再吸一口清水，噴在工匠臉上，再在上面蓋上一塊木板，用麻繩捆住四塊木板。
七天後，打開木板一看，工匠身上冒出熱氣、大汗淋漓，打個哈欠竟然坐了起來，醒過來了。人們問他有什麼感覺，他卻渾然不知，就像大夢剛醒，毫無痛苦的感覺。
飛箭入眼 老婦施術拔箭
祝由科在辰州最興盛。某年當地校園舉行閱兵儀式，有一人眼睛被飛箭擊中，箭頭深深嵌進眼中。人們急忙找來一位從事祝由科的人，這位老態龍鍾的婦人立即叫人們把傷患捆綁在廳堂前部的東邊柱子上，她站在西邊的柱子旁念咒語，念了一段時間，她隨即大喝一聲並急忙將頭偏向一邊，此時傷者眼中的箭頭立即飛出，射在西邊柱子上，扎進去約一寸深，距離她的鬢角只有幾寸遠。人們大吃一驚，再看傷者的眼睛，已經恢復完好，沒有傷痕。
摔車斷臂 劈磚治癒
有一人叫陳石民，他自述：「我在京城時曾從車上掉下來，折斷了手臂，疼痛難忍。我找到辰州祝由科的大夫，他叫我仰面躺在床上，在床旁擺上和床一般高的磚，把我的手臂擱在磚上，再用約一尺多高的磚壓在手臂上。然後他手握大斧默默祝禱，用斧背使勁向磚劈去。當他讓我再把手臂伸展出來，已經治癒了，但是磚卻從上到下都裂開了。」
這些祝由科治病的方法，用現代科學無法解釋，它是透過另外空間的事物來治療的，而現代科學手段無法探知另外空間。可見現代科學也並不是探索事物真相的唯一標準。
