《黃帝內經》共162篇，有關陰陽問題就有140篇，用到陰陽的詞句超過三千個，可見陰陽的舉足輕重。最偉大的真理往往是最簡單的，而陰陽到底是甚麼？
《周易》崇尚陽剛，老子推崇陰柔，《易經》說：「一陰一陽謂之道。」《內經》說：「陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本，神明之府也。治病必求本。」道出中國人最高境界的哲學思維中心──陰陽。
《內經》說：「天食人以五氣，地食人以五味。」人從宇宙大自然所滋養的風、暑、溼、燥、寒五氣中吸取能量，經由藏象系統進入經絡系統，而生成先天之精陽氣；再從大地所生成的酸、苦、甘、辛、鹹五味物質滋養生理解剖系統，轉化成為後天之陰精陰血，形成「陰氣內化、陽氣外榮」，人成為有大自然的一部分，也是大自然的共生體。
《內經》又說：「陰陽者，天地之道也，數之可十，推之可百，數之可千，推之可萬。萬之大，不可勝數，然其要一也。」也就是說，宇宙間、人世間數不清的萬事萬物都可歸納為一個本，這個本就是陰陽。由陰陽可無限延伸，陰陽循環，如環無端，永不止息。
舉目可見的大自然中，天為陽，地為陰；日為陽，月為陰；晝為陽，夜為陰；晴為陽，雨為陰；《易經》中陽爻陰爻所組成的八卦與二十四節氣相對應；一天中也有陰陽，上午為陽，下午為陰。《內經》說：「平旦人氣生，日中而陽氣隆，日西而陽氣已虛，氣門乃閉。」又說：「是故暮而收拒，無擾筋骨，無見霧露，反此三時，形乃困薄。」所以傍晚後的劇烈運動，是否違反自然而不健康，大有可議之處。
陰陽之妙無窮：「人生有形，不離陰陽。」陰陽有互根性，所謂「無陽則陰無以生；無陰則陽無以化。」又說：「孤陰不生，獨陽不長。」卵子與精子不結合就不會成人。陰陽又互相牽制，例如陽熱病，就要用陰寒藥來治；陰陽會互相轉化，臨床上常見寒極生熱，熱極生寒之象，例如要發燒前，却拚命打寒顫，或四肢冰冷；陰陽互相消長，所謂「陽長陰消，陰長陽消」，陰盛就會陽衰，陽盛就會陰衰，常見於夫妻間微妙關係；陰陽還會互補，所謂採陰補陽，採陽補陰，是房中術和某些氣功的技術。
陰陽的對立性隨處可見：上下、水火、動靜、升降、善惡、剛柔、怒悲、虛實、陽宅陰宅等等。陽的統一性俯拾即是：內外、表裡、氣血、前後、臟腑、陽經陰經、男女、上半身下半身、腹背等等。陰陽的變化也分層次，例如五臟為陰，心却是陰中之陽，腎為陰中之陰。陽中有陽，陰中有陽；陰陽既對立又統一，既離又合，最終要達到相互平衡、天人合一的最高境界。一旦陰陽絕離，人將魂歸西天。
《內經》養生要「法於陰陽，和於術數」。而誰能走出陰陽之外？只有修成真人者，《內經》說：「余聞上古有真人者，提掣天地，把握陰陽，呼吸精氣，獨立守神，肌肉若一，故能壽蔽天地，無有終時，此其道也。」
